Peleknya juga diberikan plesir warna merah.
Selain warna, sebenarnya masih ada perbedaan lain dari Yamaha R3 dan R25.
Perbedaan itu adalah pada desain lampu sein, milik R3 pakai mika warna kuning dan bentuknya sedikit lebih besar.
Lalu untuk R3 juga dilengkapi reflektor atau mata kucing di fender depan dan belakangnya.